Sulle montagne ad oltre 2 000 metri le temperature calano notevolmente con temperature medie tra i 5°C e i 14°C e forti escursioni termiche tra il giorno e la notte. Nella zona costiera dell'Oceano Pacifico e nelle pianure del Petén il clima è tropicale, la temperatura non scende mai al di sotto dei 25°C, con massimi estivi (luglio) di 30°C-32°C, e una media annua delle temperature intorno ai 28°C, qui le precipitazioni medie annue si attestano attorno ai 1 500 mm, in quest'area talvolta durante la stagione delle piogge (maggio-ottobre) possono verificarsi anche violenti cicloni. La zona settentrionale del paese è quella più piovosa, con medie che vanno dai 1 500 mm ai 2 500 mm, e con punte più alte in corrispondenza dei rilievi più esposti. Il periodo migliore per visitare il paese è la stagione secca, che va da fine novembre all'inizio di aprile.