La costa del mar dei Caraibi è più piovosa, qui la stagione delle piogge è lunga 9 mesi, mentre la stagione secca è tra marzo e maggio, le temperature medie annuali sono di 26°C, mentre la media delle precipitazioni annuali è di 3800 mm, in settembre-ottobre possono esservi uragani. La regione montuosa settentrionale ha un clima più fresco, con temperature medie annuali di 18°C, in questa zona la media delle precipitazioni annuali è di 1000-1500 mm, concentrate nei mesi tra maggio ed ottobre. Il miglior periodo per la visita del Nicaragua è la stagione secca da dicembre ad aprile.