La costa lungo l'oceano Pacifico presenta un clima tropicale caldo umido con una stagione delle piogge molto intensa tra dicembre e maggio. Le temperature medie sono attorno ai 23°C-26°C durante tutto l'anno. Più che si procede verso sud più il clima si fa arido, mentre verso nord si hanno circa 2500-3000 mm di pioggia all'anno, all'estremo sud della costa le precipitazioni medie annue sono sotto i 300 mm.

Il clima delle alte terre delle Ande è temperato e relativamente secco, la stagione più secca è tra giugno e settembre, mentre la stagione delle piogge è tra gennaio e maggio, le precipitazioni medie annue si mantengono tra i 500 e i 1500 mm. Le temperature medie annuali variano tra i 13°C e i 16°C, enorme è invece la differenza di temperature tra il giorno e la notte e altrettanto importante è la variazione di temperatura e di precipitazioni in relazione all'altezza, tra i 400 e 1800 metri d'altezza le temperature medie variano tra i 20°C e i 25°C con importanti e forti piogge, tra i 1800 e i 2000 metri d'altezza le temperature medie variano tra i 15°C e i 20°C con piogge moderate, tra i 2000 e i 3200 metri d'altezza le temperature medie variano tra i 10°C e i 15°C con piogge moderate attorno ai 1000 mm annui, oltre i 3200 metri le temperature medie si abbassano ulteriormente raggiungendo valori negativi.

Il bacino amazzonico ha un clima caldo-umido tipico delle foreste equatoriali, con piogge durante tutto l'anno, i mesi tra settembre e dicembre sono i più secchi, mentre luglio e agosto i più piovosi. In certe aree si superano i 5000 mm all'anno di pioggia. Le temperature medie si attestano tra i 25°C e i 28°C.

Infine le isole Galapagos hanno un clima secco con temperature medie tra i 17 °C e i 25°C durante tutto l'anno, i mesi più piovosi sono quelli tra gennaio e aprile. La media annuale delle precipitazioni è di 350 mm di pioggia lungo le coste delle isole, mentre nell'interno montuoso la media raggiunge in certe aree i 1100 mm all'anno.